任何一种热切割技术，除了可以从板块的边缘开始的情况外，一般都必须在板块上开一个小孔。以前激光冲压复合机先用冲头打孔，然后用激光从小孔切割。没有冲压装置的激光切管机设备有两种基本方法。
爆破穿孔——材料受到连续激光的照射，在中心形成凹坑，通过与激光束同轴的氧气流很快去除熔融材料，从而形成孔。一般的孔的大小与板厚有关，爆破穿孔的平均直径是板厚的一半，所以对厚板的爆破穿孔的孔径大，而且不圆，所以不应该用于加工精度要求高的零件，只能用于废料。
另外，由于穿孔时使用的氧气压力与切断时相同，因此飞散较大。
脉冲穿孔—使用峰值功率较高的脉冲激光使少量材料熔融或气化，使用空气或氮气作为辅助气体，降低发热氧化引起的孔的扩展，气体压力小于切断时的氧压力。由于每个脉冲激光只产生小的粒子喷射，阶段性地变深，所以厚板穿孔时间需要几秒钟。穿孔完成后，立即将辅助气体变成氧气切断。这样穿孔径小，其穿孔质量优于爆破穿孔。为此使用的激光不仅应该具有高功率；更重要的是光束的时间和空间特性，因此一般横流CO2激光无法满足激光切割的要求。
另外，脉冲穿孔需要更可靠的气体通道控制系统来实现气体种类、气体压力的切换、穿孔时间的控制。
